Protein–RNA interactions for Protein: P01717

IGLV3-25, Immunoglobulin lambda variable 3-25, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-25P01717 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGLV3-25P01717 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms