Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYF2O95926 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms