Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD4O95243 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD4O95243 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD4O95243 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD4O95243 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD4O95243 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD4O95243 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms