Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms