Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPLO60437 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPLO60437 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PPLO60437 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPLO60437 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPLO60437 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPLO60437 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPLO60437 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPLO60437 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPLO60437 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPLO60437 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPLO60437 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PPLO60437 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPLO60437 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms