Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAK2O60296 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms