Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms