Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KRW8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KRW8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KRW8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KRW8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KRW8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms