Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM25AB3EWG3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms