Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEMP2A6NFY4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms