Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP69A5D8W1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms