Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms