Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
L1RE1Q9UN81 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
L1RE1Q9UN81 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms