Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV5

HSF4, Heat shock factor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF4Q9ULV5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF4Q9ULV5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms