Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms