Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms