Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABRACLQ9P1F3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms