Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EHD3Q9NZN3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms