Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GDAP2Q9NXN4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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