Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms