Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms