Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms