Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KIAA1549Q9HCM3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms