Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIF1Q9H611 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIF1Q9H611 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIF1Q9H611 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PIF1Q9H611 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIF1Q9H611 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms