Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLDIP3Q9BY77 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms