Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KATNB1Q9BVA0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms