Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf50Q9BV19 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf50Q9BV19 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms