Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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