Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMSS1Q9BQ75 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMSS1Q9BQ75 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms