Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMP19Q99542 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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MMP19Q99542 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MMP19Q99542 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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