Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms