Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDLIM2Q96JY6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDLIM2Q96JY6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms