Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5RAP3Q96JB5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5RAP3Q96JB5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms