Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BORCS6Q96GS4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BORCS6Q96GS4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms