Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms