Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms