Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FAM106A-201ENST00000392176 2281 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 LINC02170-202ENST00000562231 2218 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 SAMD4B-213ENST00000610417 3664 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 LINC02172-201ENST00000507365 2264 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SVIPQ8NHG7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms