Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AVL9Q8NBF6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms