Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TTC29Q8NA56 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms