Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC63Q8NA47 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms