Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV5

USP48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48Q86UV5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP48Q86UV5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP48Q86UV5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms