Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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