Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA1Q6ZS62 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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