Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L3Q6VB84 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms