Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms