Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDC4Q6P2E9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC4Q6P2E9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms