Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A4Q6AI14 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC9A4Q6AI14 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A4Q6AI14 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms