Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALS2CLQ60I27 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALS2CLQ60I27 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms