Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC158Q5M9N0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC158Q5M9N0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms