Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CEP78Q5JTW2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms